Sommario: In un prossimo futuro, l'umanità è stata sconfitta dai parassiti virali denominati "Gastrea." gli umani sono stati esiliati in un piccolo territorio a vivere nella disperazione, fianco a fianco con il terrore. In questo mondo intrappolato nelle tenebre,Rentarou, una ragazzo di Tokyo è membro della "Sicurezza Civile", una organizzazione specializzata nella lotta contro i Gastrea, viene utilizzato nelle attività pericolose. Il suo partner è Enju, una giovane ragazza. Combattono usando i loro poteri, finché un giorno, ricevono un incarico speciale da parte del governo. Questa missione top secret è quella di prevenire la distruzione di Tokyo...